Akreditasi sejatinya adalah suatu pengakuan formal yang diberikan oleh badan akreditasi terhadap kompetensi suatu lembaga atau organisasi. Akreditasi ini biasanya dilakukan lima tahun sekali oleh BAN SM. MIN 6 Magelang terakhir diakreditasi yaitu tahun 2013 dan bernilai A. pada tanggal 5-6 Agustus 2019 MIN 6 Magelang diakreditasi oleh BAN SM yakni Asesor nya yaitu Bapak Sukirno,M.Pd. dan Bapak Fajar Sugiharto, S.Pd. Drumband Madina Nada Bahana dan pencak silat MIN 6 Magelang juga ikut memeriahkan dan menyambut Asesor. Visitasi pada hari pertama yaitu Asesor melakukan visitasi 8 standar yakni standar 1-4 oleh asesor 1 dan standar 5-8 oleh asesor 2 . Visitasi hari kedua yaitu asesor menilai kegiatan belajar yang ada di MIN 6 dan melakukan visitasi silang .